两汉时期为扶馀国的属地;扶馀灭亡后,从南北朝到隋唐初期,属靺鞨地;唐代,接受渤海国称号时,属渤海的扶馀府(今农安)辖境;元代属开元路辖境(开元路曾在黄龙府,后又迁到今开原);明代属奴儿干都司管辖。清康熙九年至二十年(1670-1681年)在吉林省境内修筑柳条边(俗称边墙),防止汉人和蒙古人进入,并在境内设有四个边门,沿边墙四个边门,共置二十八个边台,今九台县就是这二十八个边台之一,是北数第九台。九台分上九台、下九台。县城设在下九台,后改为九台,成为县名。1932年设治建县,1988年撤县设市,2014年撤市设区。
九台作为清代柳条边上的百年古镇,是关东文化的代表性区域,被誉为“中国萨满文化之乡”“中国满族剪纸艺术之乡”和“中国鹰猎文化之乡”。牛连和水墨画、关云德满族剪纸、王挺起民俗剪纸享誉海内外。编制实施全域旅游发展规划,谋划116个重点项目,2023年全区接待游客达到1500万人次,同比增长150%,旅游综合收入实现30亿元,同比增长87.5%。